高速计数器工作模式分为下面4大类：
1、无外部方向输入信号的单相加/减计数器（模式0-2）；可以用高速计数的控制字节的第3位来控制加计数或减计数。该位为1时为加计数，为0时为减计数。
2、有外部方向输入信号的单相加/减计数器（模式3—5）；方向输入信号为1时为加计数，为0时为减计数。
3、有加计数时钟脉冲和减计数时钟脉冲输入的双相计数器（模式6-8）；若加计数脉冲和减计数脉冲的上升沿出现的时间间隔不到0.3ms，高速计数器会认为这两个事件是同时发生的，当前值不变，也不会有计数方向变化的指示。反之，高速计数器能够捕捉到每一个独立事件
4、A/B相正交计数器（模式9-11）；它的两路计数脉冲的相位互差90°，正转时A相时钟脉冲比B相时钟脉冲超前90°，反转时A相时钟脉冲比B相时钟脉冲滞后90°，利用这一特性可以实现在正转时加计数，反转时减计数。
A/B相正交计数器可以选择1倍频（1X）模式和4倍频（4X）模式，在1倍频模式，时钟脉冲的每一周期计1次数，在4倍频模式，时钟脉冲的每一周期计4次数。两相计数器的两个时钟脉冲可以同时工作在最大速率，全部计数器可以同时以最大速率运行，互不干扰。
根据有无复位输入和启动输入，上述的4类工作模式又可以各分为3种，因此HSC1和HSC2有12种工作模式；HSC0和HSC4因为没有启动输入，只有8种工作方式；HSC3和HSC5只有时钟脉冲输入，所以只有1种工作方式。
正交1Ⅹ模式
正交4x模式
